Leçons tirées de l’enquête Anaerobe: perspective historique et examen des données les plus récentes –

Contexte La raison d’être et les leçons tirées de l’évolution de l’Enquête nationale sur la sensibilité au Bacteroides fragilis du début à la fin sont examinées ici. L’enquête a été conçue pour suivre la résistance antimicrobienne émergente chez les espèces Bacteroides. Les concentrations minimales inhibitrices des antibiotiques ont été déterminées à l’aide d’une dilution en gélose conformément aux recommandations du Clinical and Laboratory Standards InstituteRésultats Les analyses ont révélé que les concentrations minimales inhibitrices des antibiotiques ont été déterminées à l’aide d’une dilution en gélose. les carbapénèmes imipénème, méropénem, ​​ertapénème et doripénème et pipéracilline-tazobactam étaient les agents les plus actifs contre ces agents pathogènes, avec des taux de résistance de% -%. Au cours des dernières années de l’enquête, la résistance à certains agents dépendait de espèces, telles que l’ampli icilline-sulbactam contre Bacteroides distasonis% et tigécycline contre Bacteroides uniformis et Bacteroides eggerthii ~% Très haute résistance% & ont été notés pour moxifloxacin et trovafloxacin, en particulier contre Bacteroides vulgatus Pendant cette période d’étude, les espèces non-B fragilis Bacteroides avaient & gt; En résumé, la résistance aux antibiotiques était plus grande chez les espèces non B Bacteroides que chez les B. fragilis et était particulièrement plus élevée chez les espèces à faible fréquence d’isolement, telles que les souches de Bacteroides résistantes au métronidazole. Bacteroides caccae et B uniformis L’émergence de la résistance chez les espèces non B fragilis Bacteroides souligne le besoin de spéciation des isolats du groupe B fragilis et pour les cliniciens d’être conscients des associations entre les espèces et la résistance aux médicaments

Francis P Tally et Sherwood L Gorbach ont conçu une étude nationale sur la sensibilité de Bacteroides fragilis et des espèces apparentées à différents antimicrobiens. Les raisons de cette étude étaient la reconnaissance de la résistance antibiotique transmissible plasmidique à la clindamycine. qu’une telle résistance transférable pourrait rendre la clindamycine inefficace, reconnaissant que la sensibilité des espèces Bacteroides aux antimicrobiens était associée à un meilleur résultat , et que les différentes susceptibilités des espèces Bacteroides aux antimicrobiens dépendaient de la localisation géographique Enfin, parce que les laboratoires hospitaliers Ils n’ont généralement pas la capacité de tester la sensibilité des espèces de Bacteroides, les cliniciens ont besoin d’informations sur les schémas régionaux ou nationaux, de choisir les agents appropriés pour les traitements empiriques. Des centres de soins de santé et un certain nombre de chercheurs ont participé à l’enquête. ethod utilisé à partir de travers, complété gélose infusion cerveau-coeur a reçu un inoculum de × In, l’enquête a adopté la méthode recommandée cette année par le Clinical and Laboratory Standards Institute CLSI; anciennement, Comité national des étalons de laboratoire clinique; avec cette méthode, supplémenté brucella sang agar utilisé un inoculum de × Les antibiotiques testés sont énumérés dans le tableau Au cours des dernières années de l’enquête, les antibiotiques testés ont changé à mesure que de nouveaux agents ont été introduits Les agents qui ont été continuellement testés étaient clindamycine, céfoxitine, Le métronidazole et le chloramphénicol L’analyse statistique a d’abord été réalisée à l’aide d’un ordinateur TRS / Model de Radio Shack Il est ironique que les montres-bracelets contemporaines aient plus de puissance de calcul que cette première version du TRS / Current. Institut

Vue de la table largeTélécharger la fiche Aperçu de l’enquête sur les espèces de Bacteroides -Table Agrandir la photoDétaillée de l’enquête sur les espèces de Bacteroides -Au début des années, parmi les isolats de l’espèce Bacteroides analysés en tant que groupe,% étaient résistants à la clindamycine et% résistants à céfoxitine En revanche, par, la résistance à la clindamycine avait augmenté à%, bien que la résistance à la céfoxitine soit restée relativement constante à% Le tableau montre les changements de susceptibilité survenus au cours des décennies de l’étude

Vue de la table largeTéléchargement de la résistancePourcentage de toutes les espèces du groupe Bacteroides fragilis pour sélectionner les antibiotiques à travers la table ViewDifference de la diapositive slideTour de toutes les espèces du groupe Bacteroides fragilis pour sélectionner les antibiotiques par le biais du groupe d’enquête a été responsable de & gt; Des publications [, -], et un certain nombre de thèmes et de principes ont émergé. La sensibilité des espèces de Bacteroides aux antimicrobiens est importante pour le résultat, même en présence d’infections mixtes Par exemple, dans le contexte de Bacteroides bactériémie due à une infection mixte Le groupe d’enquête a contribué à établir des critères de sensibilité pour certains antibiotiques pour le CLSI. Pour les études de développement de médicaments, l’enquête a fourni un cadre d’activité qui fournit aux entreprises pharmaceutiques des données pour d’autres études. développement clinique En outre, le groupe a apporté des contributions majeures à l’utilisation de différents médias et méthodes d’essai Pour ce symposium en l’honneur de Frank Tally, MD, nous avons analysé les données sur la sensibilité aux médicaments des espèces Bacteroides à travers, à examiner l’évolution dans le temps de certaines combinaisons de médicaments et d’organismes, ainsi que des variations régionales

Méthodes

Centres médicaux Depuis le début, des isolats ont été envoyés par les centres médicaux suivants représentant diverses régions des États-Unis: Albany Medical Center, Albany, New York -; Carolinas Medical Center, Charlotte, Caroline du Nord,, et; Danbury Hospital, Danbury, Connecticut; Centre médical de l’Université Duke, Durham, Caroline du Nord -; Centre médical de l’Université Loyola, Maywood, Illinois -; New England Medical Center, Boston, Massachusetts -; Centre médical Mount Sinai, New York, New York -; Centre d’administration des vétérans de Pittsburgh, Pittsburgh, Pennsylvanie -; R M Laboratoires de recherche Alden, Santa Monica, Californie -; Centre médical de l’Université du Maryland, Baltimore, Maryland -; Centre médical de l’Université du Michigan, Ann Arbor, Michigan -; Wadsworth Veterans Administration Hospital, Los Angeles, Californie -; et Mayo Clinic, Rochester, Minnesota Agents antimicrobiens Des poudres standard des antibiotiques ont été obtenues auprès des fabricants suivants: céfoxitine, ertapénème et imipénème de Merck; l’ampicilline et le sulbactame de Pfizer; la pipéracilline, le tazobactam et la tigécycline de Wyeth-Ayerst Research; le méropénem d’AstraZeneca Pharmaceuticals; doripenem testé seulement pendant – de Johnson & amp; Johnson; la moxifloxacine de Bayer Pharmaceuticals; et isolats bactériens de la clindamycine, du métronidazole et du chloramphénicol de Sigma-Aldrich Un total d’isolats cliniques non dupliqués du groupe B fragilis ont été envoyés au Laboratoire d’études spéciales du Tufts Medical Center de Boston (Massachusetts) par les centres médicaux participant à l’enquête. ont été expédiées sur des plaques d’agar préréduites et ont été conservées jusqu’au moment du test. L’identification des isolats a été confirmée en utilisant une méthodologie rapide API A [bioMèrieux], RapID Ana II [Remel], ou An-IDENT [bioMèrieux] l’identification a été confirmée par des méthodes standard décrites dans le Wadsworth Anaerobic Bacteriology Manual et / ou dans le Anaerobic Laboratory Manual du Virginia Polytechnic Institute Test de sensibilité Concentrations minimales inhibitrices Les CMI ont été déterminées par dilution selon l’agar. ,] Les plaques ont été préparées le jour de l’essai avec u d’agar brucella enrichi en agar brucella enrichi en% de globules rouges de mouton défibrinés lysés et en μg / mL de vitamine K Pour la préparation des inoculums, les organismes ont été cultivés en phase logarithmique et la turbidité a été ajustée à celle d’un étalon McFarland. Unités formant des colonies / mL Les inoculums ont été livrés à la surface de la plaque d’agar en utilisant un réplicateur de Steers, ce qui a entraîné une concentration en organismes x unités / taches formant des colonies. Les plaques inoculées ont été incubées à ° C dans une chambre anaérobie pour Les tests ont été répétés lorsque les CMI des organismes témoins étaient en dehors de la plage spécifiée par les recommandations du Comité national des normes de laboratoire clinique – ou CLSI – [collection de cultures de type American Type of Culture et Bacteroides thetaiotaomicron. ,] Analyse des données Les données ont été stockées dans des feuilles de calcul Microsoft Excel L’analyse statistique a été effectuée en utilisant SAS pour Windows, ver Les tendances de résistance aux médicaments ont été déterminées par le test de Cochran-Armitage Les points de rupture pour la résistance aux antibiotiques étaient ceux recommandés par le CLSI Breakpoints établis par la Food and Drug Administration des États-Unis pour La résistance aux anaérobies a été utilisée pour la tigécycline Les tendances pour les CMI augmentées ou diminuées au cours du temps ont été évaluées à l’aide d’une analyse de régression linéaire sur les résultats du CMI log.

Résultats

Le tableau montre la distribution, par espèce, des isolats inclus dans l’étude. B fragilis est restée l’espèce la plus fréquemment isolée au cours des années de notre étude; cependant, on a observé une tendance à la réduction de la fréquence d’isolement d’une moyenne de% durant les premières années à une moyenne de% au cours des dernières années, en conjonction avec une augmentation de% de la fréquence d’isolement de la population non B Les isolats de B ovatus comprenaient% des isolats totaux, et% étaient Bacteriodes vulgatus Bacteroides caccae, une espèce précédemment incluse dans la catégorie «autres» Bacteroides, a été isolée à une fréquence plus élevée, similaire à celle de Bacteriodes distasonis% et Bacteroides uniformis%; ainsi, il est listé séparément durant les dernières années de l’étude

Tableau Vue largeDownload slideDistribution des espèces dans le groupe Bacteroides fragilis -Table View largeDownload slideDistribution des espèces dans le groupe Bacteroides fragilis -Dans la plupart des cas, la majorité des isolats sanguins étaient B fragilis La majorité des isolats non sanglants ont été trouvés dans des échantillons provenant de La résistance en pourcentage a été calculée en utilisant les points de rupture recommandés pour l’antibiotique respectif par le CLSI ou Food and Drug Administration Pour les carbapénèmes, une faible résistance a été observée chez B distasonis et B uniformis Dans cette classe d’agents, l’ertapénem a également montré une faible résistance chez B ovatus et B thetaiotaomicron. L’activité de piperacillin-tazobactam était similaire à celle des carbapénèmes et supérieure à celle de l’ampicilline-sulbactam, qui continuait à montrer une résistance accrue à l’activité B distasonis. contre B distasonis était plus élevé f rom à travers% qu’il ne l’était à travers%; données non montrées La résistance de B ovatus à la céfoxitine au cours de cette période ~% était similaire à celle des années précédentes

Tableau View largeDownload slideSusceptibilités des isolats dans le groupe Bacteroides fragilis -Table Voir grandDownload slideSusceptibilités des isolats dans le groupe Bacteroides fragilis -La tigécycline était l’antibiotique le plus actif parmi les agents non-β-lactamines clindamycine, linézolide, tigécycline, moxifloxacine et trovafloxacine. Le second agent le plus actif dans ce groupe était le linézolide, avec une résistance allant de% pour l’uniformis B à% pour B distasonis et B ovatus. La résistance des espèces Bacteroides à la clindamycine variait de% Pour plus de la moitié des isolats de B vulgatus étaient résistants à la moxifloxacine% et à la trovafloxacine% La résistance à ces fluoroquinolones augmentait avec le temps pour la plupart des espècesIsolates dans le groupe des « autres » espèces Bacteroides Bacteroides eggerthii, Bacteroides merdae, et Bacteroides nordii a montré une assez grande h taux de résistance à la tigécycline Dans ce groupe, nous avons également observé des taux plus élevés de résistance à la moxifloxacine% et à la clindamycine% En général, les CMI requises pour inhiber la croissance de% des microorganismes MIC pour les carbapénèmes, pipéracilline-tazobactam et tigécycline contre Par comparaison, la CMI de la clindamycine, de la moxifloxacine et de la trovafloxacine était égale ou supérieure au point de rupture pour la résistance à toutes les espèces. De plus, le CMI requis pour inhiber la croissance du% de La CMI de l’ampicilline-sulbactam et de la céfoxitine était égale au point de rupture de la résistance contre B distasonis et B ovatus, respectivement. La Figure A et la Figure B montrent les taux de résistance au-dessus de B vulgatus. temps – pour des combinaisons d’antibiotiques sélectionnées La figure A montre la variation de résistance pour les deux combinaisons d’inhibiteurs à B vul gatus Les données sur B vulgatus pour la dernière année indiquent qu’il n’y avait pas de résistance à la pipéracilline-tazobactam, alors que la résistance à l’ampicilline-sulbactam est restée approximativement la même pendant et en% et en% respectivement. Au cours de la période étudiée, la résistance à la céfoxitine chez B ovatus, B thetaiotaomicron et B distasonis a été considérablement réduite au cours de la période étudiée contre-indication. Cette tendance est particulièrement remarquable pour B distasonis, où la résistance a été réduite de & gt; %

Figure Vue largeDésignation de la résistance des espèces Bacteroides aux antibiotiques sélectionnés au fil du temps – Les barres bleues indiquent une augmentation de la résistance pendant -, les cercles bleus indiquent une résistance pendant et les barres rouges indiquent des résistances inférieures à B, Résistance des espèces Bacteroides à la tigécycline, à la clindamycine et à la moxifloxacine – Les barres bleues indiquent une augmentation de la résistance pendant -, les cercles bleus indiquent une résistance pendant et les barres rouges indiquent les cas où la résistance était plus faible que chez les autres. – Les barres bleues indiquent une augmentation de la résistance pendant -, les cercles bleus indiquent la résistance pendant et les barres rouges indiquent les cas où la résistance était inférieure à B, Résistance des espèces Bacteroides à la tigécycline, clindamycine et moxifloxacine – Les barres bleues indiquent une augmentation en résistance pendant -, les cercles bleus indiquent une résistance Les taux de résistance à la tigécycline, à la clindamycine et à la moxifloxacine passant de Résistance à la tigécycline chez B fragilis et B uniformis sont demeurés stables, bien que pendant cette période, le B fragilis% et inférieur pour B uniformis% par rapport à l’année précédente La résistance à la clindamycine a augmenté de ~% pour B fragilis et B thetaiotaomicron% et%, respectivement, pendant la résistance à la moxifloxacine était assez élevé; il a augmenté à% pour B ovatus pendant et à ~% pour B fragilis à partir de, les isolats résistants au métronidazole ont été confirmés dans notre enquête; La résistance au métronidazole a été de plus en plus fréquemment signalée en Europe mais pas aux États-Unis. Tout au long de l’enquête, la sensibilité à certains antibiotiques variait selon les centres de santé et les espèces Pour certains antibiotiques, tels que la clindamycine ou moxifloxacine, la gamme de résistance variait grandement selon le centre de soins de santé L’analyse de la variation d’une année à l’autre entre les centres de santé a révélé certaines différences, mais la plupart des taux de résistance sont demeurés relativement constants.

Conclusions

L’enquête a fourni plusieurs informations sur la sensibilité des espèces de Bacteroides aux médicaments Certains médicaments ont une activité constante ou accrue, tandis que d’autres ont une activité réduite contre l’espèce. Les tendances ne sont pas toujours prévisibles, variant selon les régions et les institutions. des profils ont été trouvés: B ovatus était plus résistant aux carbapénèmes que les autres espèces de Bacteroides, B vulgatus était plus résistant à la pipéracilline-tazobactam, B distasonis était plus résistant à l’ampicilline-sulbactam et la céfoxitine, B ovatus et B uniformis étaient hautement résistants à la moxifloxacine Les autres espèces de Bacteroides étaient plus résistantes à la tigécycline En général, B fragilis est plus sensible aux antimicrobiens que les autres espèces de Bacteroides Ces données fournissent un guide général pour le clinicien dans le traitement des infections anaérobies. L’enquête devrait élargir son champ d’action à l’avenir. La relation entre l’utilisation d’antimicrobiens et la résistance à ces agents serait un autre point important. Les isolats fécaux sont-ils plus sensibles que les isolats cliniques? La détection moléculaire de la résistance au métronidazole et au carbapénème, ainsi que d’autres marqueurs génétiques, est un autre domaine de recherche. importance croissante Enfin, les rapports en temps réel basés sur Internet de la pharmacorésistance sont de plus en plus répandus et pourraient être appliqués à l’enquête. L’étude de susceptibilité anaérobie est en cours depuis des années, en partie grâce à la vision de Francis P. une quantité énorme de données microbiologiques cliniquement utiles pour le clinicien en exercice

Figure Vue largeTéléchargerTouves New England Medical Center Division des maladies infectieuses, juin Rangée de gauche à droite: Francis P Tally, Jeffrey A Gelfand, Sherwood L Gorbach, Michael Barza, Te-Wen Chang et John G Bartlett Rangée du milieu de gauche à droite: Ted Butler , David R Snydman, Katherine McGowan, Gary Simon, Michael Lauerman Rangée de gauche à droite: Stephen Kornfeld, César Elster, Ray Saginur, Keith JoinerFigure Vue largeTéléchargerTufts New England Medical Center Division des maladies infectieuses, Juin Rangée de gauche à droite: Francis P Tally, Jeffrey A Gelfand, Sherwood L Gorbach, Michael Barza, Te-Wen Chang, John G Bartlett Deuxième rangée de gauche à droite: Ted Butler, David R. Snydman, Katherine McGowan, Gary Simon, Michael Lauerman Rangée de gauche à droite: Stephen Kornfeld , Cesar Elster, Ray Saginur et Keith Joiner

Remerciements

Nous remercions les personnes qui ont apporté leur soutien technique au cours des dernières années, à savoir Carolina Baez-Giangreco, Barbara Rapino et Tara Wozniak. Conflits d’intérêts potentiels DRS a reçu des fonds de recherche de Cubist, Merck, Aston-Fence, Johnson & amp; Johnson et Wyeth; a été consultant pour Schering-Plough; et a servi sur les bureaux des conférenciers pour Merck et Cubist JER a reçu des redevances de Roche Diagnostics qui ne sont pas liés à cette étude YG a été un investigateur dans un essai clinique pour Optimer Pharmaceuticals EJCG a siégé aux conseils consultatifs de Merck, Schering-Plough, Optimer, Theravance et Viropharma; a siégé aux bureaux des conférenciers pour Schering-Plough, Ortho-McNeil, Bayer et Merck; et a reçu des subventions de recherche de Merck, de Schering-Plough, d’Optimer, de Theravance, de Cubist, de Pfizer, d’Astellas, de Cerexa et d’Impex. SJ a été consultant pour Schering-Plough et Johnson & amp; Johnson et a servi sur le bureau des conférenciers pour Wyeth Tous les autres auteurs: pas de conflitsSupport financier AstraZeneca, Wyeth-Ayerst, Merck, Johnson & amp; Johnson, Novartis, Bayer, Pfizer, SmithKline Beecham, et parrainage UpjohnSupplement Cet article fait partie d’un supplément intitulé « Symposium en l’honneur de la mémoire de Francis P Tally, MD, tenu au Tufts Medical Center et Tufts University School of Medicine, Juin, « Qui a été parrainé par Tufts Medical Center, avec une subvention sans restriction de Cubist Pharmaceuticals